Em relação a nistatina, não são conhecidas interações com outros medicamentos e/ou substâncias.
A Nistatina é geralmente bem tolerada por todos os grupos de idade incluindo crianças debilitadas mesmo em terapia prolongada. Grandes doses orais têm ocasionalmente produzido náuseas, vômitos, diarréia, distúrbios gastrintestinais. Erupções cutâneas, incluindo urticária, raramente foram relatadas. Existem relatos raros de síndrome de Stevens Johnson.